Determinação da atividade antitirosinase e antioxidante de Myrsine coriacea (Sw. ) R. Br. ex Roem. & Schult. (Primulaceae) / Determination of the antityrosinase and antioxidant activity of Myrsine coriacea (Sw. ) R. Br. ex Roem. & Schult. (Primulaceae)

myrsine coriacea (Sw.) R. Br. ex Roem. & Schult. (Primulaceae) conhecida popularmente como capororoquinha ou capororoca, é amplamente distribuída nas regiões sul e sudeste do Brasil. As espécies desse gênero apresentam um potencial antioxidante e anti-inflamatório, que pode ser acessado na busca de novos ativos para o tratamento de desordens pigmentares da pele. Desta forma, este trabalho teve como objetivos avaliar o potencial antitirosinase e antioxidante de extratos e frações de M. coriacea e identificar os possíveis compostos responsáveis por essas atividades. Foram realizados ensaios para avaliar o potencial antioxidante das amostras através do método do DPPH, enquanto a capacidade hipopigmentante das amostras foi avaliado pela inibição da enzima tirosinase. Como complemento, foram determinados os teores de compostos fenólicos totais e flavonoides através dos métodos colorimétricos empregando o reagente Folin-Ciocalteau e AlCl3. Adicionalmente, os extratos de M. coriacea tiveram avaliados seus potenciais citotóxicos utilizando diferentes linhagens tumorais humanas. O perfil fitoquímico de M. coriacea foi analisado por cromatografia a gás acoplada com espectrometria de massas (CG-EM) e cromatografia em camada delgada (CCD) com padrões. Nessas análises foram identificados 34 compostos, sendo o ácido palmítico e o palmitato de etila os compostos majoritários nas amostras de M. coriacea. O extrato bruto das folhas apresentou o maior teor de fenólicos totais, enquanto a fração de acetato de etila das folhas teve o maior teor de flavonoides. Contudo, o extrato bruto dos frutos apresentou a melhor atividade antioxidante de todas as amostras analisadas, apresentando também a melhor atividade antitirosinase. Dentre os compostos anotados, mandenol, ácido -linoleico e o linolenato de etila foram os compostos considerados como possíveis inibidores da tirosinase, com boa interação molecular com a enzima nas análises de ancoragem molecular in silico. Das amostras analisadas com relação a inibição de crescimento frente as células tumorais, a amostra da fração de clorofórmio das folhas foi a que apresentou potencial antitumoral frente as células de adenocarcinoma de cólon (HCT116)

myrsine coriacea (Sw.) R. Br. ex Roem. & Schult. (Primulaceae) popularly known as capororoquinha or capororoca, is widely distributed in southern and southeastern Brazil. Myrsine species have an antioxidant and anti-inflammatory potential, which can be accessed in the search for new actives for the treatment of skin pigmentation disorders. Thus, this work aimed to evaluate the antityrosinase and antioxidant potential from extracts and fractions of M. coriacea and to identify the probable compounds responsible for these activities. Assays were performed to evaluate the antioxidant potential of the samples using the DPPH method, while the hypopigmentation capacity of the samples was evaluated by the tyrosinase inhibition. As a complement, the amounts of total phenolic compounds and flavonoids were determined through colorimetric methods using the Folin-Ciocalteau reagent and AlCl3. Additionally, M. coriacea extracts had their cytotoxic potential evaluated using different human tumor cell lines. M. coriacea phytochemical profile was obtained by gas chromatography coupled with mass spectrometry (GC-MS) and thin layer chromatography (TLC) with standards. In these analyses, 34 compounds were identified, with palmitic acid and ethyl palmitate as the major compounds in M. coriacea samples. The leaf crude extract presented the highest total phenolics contents, while the leaf ethyl acetate fraction had the highest flavonoid amounts. However, the fruit crude extract showed the best antioxidant and antityrosinase activities of all analyzed samples. Among the annotated compounds, mandenol, -linoleic acid and ethyl linolenate were the compounds considered as putative tyrosinase inhibitors, presenting good molecular interaction with the enzyme active site in the in silico molecular docking analysis. The leaf chloroform fraction was the only sample that showed an antitumor potential against colon adenocarcinoma cells (HCT116)

Fosfatase Cdc25B: Interações transientes intramoleculares e complexação com pequenos ligantes / Cdc25B phosphatase: Transient intramolecular interactions and small molecules complexation

Proteínas tirosina-fosfatase (PTPs) possuem papel fundamental na regulação da transdução de sinais e estão envolvidas em diversos processos fundamentais do ciclo celular. As Cdc25 (Cell Division Cycle 25) são fosfatases duais encontradas em todos os organismos eucarióticos e atuam em checkpoints do ciclo celular, permitindo ou inibindo o prosseguimento deste. Este grupo de proteínas pertence à classe de PTPs com atividade baseada em cisteína, apresenta domínio catalítico altamente conservado assim como o motivo catalítico, P-loop. Devido sua função, as Cdc25 são consideradas possíveis alvos terapêuticos para tratamento de câncer e sua interação com pequenas moléculas e inibidores tem sido investigada de forma que análises estruturais e de ligação das Cdc25 com inibidores podem elucidar aspectos importantes do mecanismo de ação destes além de direcionar para o desenho racional de fármacos. Interações cátion-π são interações intra ou intermoleculares não-covalentes que ocorrem entre uma espécie química catiônica, como o grupo guanidino de argininas, e uma das faces de um sistema π rico em elétrons, como dos anéis indólicos de triptofanos. Apesar de pouco discutidas na literatura, quando em comparação às interações não-covalentes mais convencionais, do ponto de vista energético as interações cátion-π são tão importantes na estruturação de proteínas quanto às ligações de hidrogênio ou pontes salinas. De fato estas interações são observadas com frequência em estruturas proteicas resolvidas. O domínio catalítico da Cdc25B possui diversas argininas expostas em sua superfície e um único resíduo de triptofano localizado na região C-terminal flexível, muito próximo do sítio catalítico da proteína. A flexibilidade de proteínas ou de regiões proteicas apresenta importante papel no reconhecimento entre biomoléculas participantes de vias de sinalização e tem sido muito estudada atualmente. Aqui, simulações de dinâmica molecular, experimentos de 1H-15N HSQC RMN, ensaios de cinética de inibição e de ancoragem molecular, evidenciam a existência de contatos cátion-π transientes na superfície de um importante membro da família das Cdc25, a Cdc25B, e de sítios de interação entre inibidores testados e a proteína com destaque a sítios na proximidades do P-loop, região próxima ao C-terminal desordenado, onde se demonstra estabilidade da interação com os pequenos ligantes

Protein tyrosine phosphatase (PTPs) play a fundamental role in the regulation of signal transduction and are involved in several fundamental processes of the cell cycle. Cdc25 (Cell Division Cycle 25) are dual phosphatases found in all eukaryotic organisms and act at checkpoints of the cell cycle, allowing or inhibiting its progression. This group of proteins belongs to the class of PTPs with cysteine-based activity, presenting a highly conserved catalytic domain as well as the catalytic motif, P-loop. Due to their function, Cdc25 are considered possible therapeutic targets for cancer treatment and their interaction with small molecules and inhibitors has been investigated so that structural and binding analyzes of Cdc25 with inhibitors can elucidate important aspects of their mechanism of action besides directing to rational drug design. Cation-π interactions are non-covalent intra- or intermolecular interactions that occur between a cationic chemical species, such as the guanidino group of arginines, and one of the faces of an electron-rich system, such as the indole rings of tryptophans. Although little discussed in the literature, when compared to more conventional non-covalent interactions, from the energetic point of view, cation-π interactions are as important in the structuring of proteins as hydrogen bonds or salt bridges. In fact, these interactions are frequently observed in solved protein structures. The catalytic domain of Cdc25B has several arginines exposed on its surface and a single tryptophan residue located in the flexible C-terminal region, very close to the catalytic site of the protein. The flexibility of proteins or protein regions plays an important role in the recognition between biomolecules participating in signaling pathways and has been extensively studied today. Here, molecular dynamics simulations, 1H-15N HSQC NMR experiments, inhibition kinetics and molecular anchoring assays, evidence the existence of transient cation-π contacts on the surface of an important member of the Cdc25 family, Cdc25B, and of sites of interaction between tested inhibitors and the protein, with emphasis on sites in the vicinity of the P-loop, a region close to the disordered C-terminus, where stability of the interaction with the small ligands is demonstrated

Evaluation of interactions of silibinin with the proteins ALS3 and SAP5 against Candida albicans / Avaliação das interações da silibinina com as proteínas ALS3 e SAP5 contra Candida albicans

Objective: to evaluate the molecular interaction of silibinin with the targets ALS3 and SAP5. Methodology: Molecular docking protocols were conducted to analyze the binding interaction of silibinin with ALS3 and SAP5. Results: Eleven interactions of ALS3 with silibinin and four with fluconazole were found, while six interactions were observed of SAP5 with silibinin and four with fluconazole. Conclusion: Molecular docking between silibinin and ALS3 identified important interactions, but no significant interactions were observed with SAP5, even though silibinin can exhibit affinity and interactions with other SAP5 sites.

Objetivo: Avaliar a interação molecular da silibinina com os alvos ALS3 e SAP5. Metodologia: Protocolos de docking molecular foram conduzidos para analisar a interação de ligação da silibinina com ALS3 e SAP5. Resultados: Foram encontradas onze interações de ALS3 com silibinina e quatro com fluconazol, enquanto seis interações foram observadas de SAP5 com silibinina e quatro com fluconazol. Conclusão: Docking molecular entre silibinina e ALS3 identificou interações importantes, mas não foram observadas interações significativas com SAP5, embora a silibinina possa apresentar afinidade e interações com outros sítios SAP5.

Study of the interactions of di- and tri-terpenes from Stillingia loranthacea with the enzyme NSP16-NSP10 of SARS-CoV-2 / Estudo das interações de di- e tri-terpenos de Stillingia loranthacea com a enzima NSP16-NSP10 de SARS-CoV-2

Objective: This study aimed to evaluate the interactions of di- and tri-terpenes from Stillingia loranthacea with the enzyme NSP16-NSP10 of SARS-CoV-2, important for viral replication. Methods: The molecular docking technique was used to evaluate this interaction. Results: The analysis showed that the evaluated compounds obtained RMSD values of 0.888 to 1.944 Å and free energy of -6.1 to -9.4 kcal/mol, with the observation of hydrogen bonds, salt bridges, and pi-sulfur, pi-alkyl, and hydrophobic interactions. Conclusion: Thus, the results obtained show the potential of the compounds analyzed against the selected target. Since computer simulations are only an initial step in projects for the development of antiviral drugs, this study provides important data for future research.

Objetivo: avaliar as interações de di- e tri-terpenos de Stillingia loranthacea com a enzima NSP16-NSP10 de SARS-CoV-2, importante para a replicação viral. Métodos: A técnica de docking molecular foi utilizada para avaliar essa interação. Resultados: A análise mostrou que os compostos avaliados obtiveram valores de RMSD de 0,888 a 1,944 Å e energia livre de -6,1 a -9,4 kcal/mol, observando-se ligações de hidrogênio, pontes salinas e pi-enxofre, pi-alquil, e interações hidrofóbicas. Conclusão: Assim, os resultados obtidos mostram o potencial dos compostos analisados frente ao alvo selecionado. Como as simulações computacionais são apenas um passo inicial nos projetos de desenvolvimento de medicamentos antivirais, este estudo fornece dados importantes para pesquisas futuras.